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課程名稱 |
系統微生物學
Systems Microbiology |
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開課學期 |
105-2 |
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授課對象 |
生命科學院 生化科技學系 |
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授課教師 |
薛雁冰 |
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課號 |
BST5049 |
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課程識別碼 |
B22 U0530 |
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班次 |
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學分 |
2.0 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
必修 |
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上課時間 |
星期二3,4(10:20~12:10) |
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上課地點 |
農化一第六 |
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備註 |
微生物與細胞科技領域。與黃慶璨、林晉玄、吳承合開
總人數上限：40人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1052BST5049_ |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
本課程尚未建立核心能力關連 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
本課程為微生物學進階課程，目的為以系統研究的方式(體學; -omics)
來呈現微生物的生理代謝或與外界環境及其他生物的相互關係，讓學
生可以藉此瞭解微生物學跨領域的應用與發展趨勢，以及對其他科學
領域的重要性。本課程導入基因體學、轉錄體學、蛋白質體學、代謝
體學及合成生物學等學科知識與工具，可以使學生全面性瞭微生物與
環境互動的分子機制與模型。 |
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課程目標 |
待補 |
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課程要求 |
修課資格：限本系學士班高年級以上學生
先修課程：微生物學(含實驗) |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
每週二 10:20~12:20 |
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指定閱讀 |
待補 |
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參考書目 |
參考書目：
The conceptual foundations of systems biology: an introduction, Marcum, Nova Science, 2009
Systems biology and synthetic biology, Fu & Panke, John Wiley & Sons, 2009
Systems biology: functional strategies of living organisms, Konieczny et. al, Springer, 2014
內容以上課講義為主。 |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
■考試 ■作業 ■出席 ■平時參與 |
100% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
2/21 |
Course introduction: What is systems microbiology/ Microbiota and environments/ Sequencing technology 薛雁冰 |
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第2週 |
2/28 |
228 紀念日 |
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第3週 |
3/07 |
Microbial genomics and evolutionary implications I: Bacteria 薛雁冰 |
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第4週 |
3/14 |
出國開會，視情況於 3/25 補課
Microbial host interaction-C. elegans as a model for systems microbiology 薛雁冰 |
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第5週 |
3/21 |
Microbial genomics and evolutionary implications II : Fungi and other eukaryotic microbes 薛雁冰 |
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第6週 |
3/28 |
Transcriptomics-Omics in drug resistance 林晉玄 |
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第7週 |
4/04 |
清明節 |
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第8週 |
4/11 |
Transcriptomics- Omics in biofilms 林晉玄 |
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第9週 |
4/18 |
學生團隊報告1- 林晉玄 |
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第10週 |
4/25 |
學生團隊報告2- 林晉玄 |
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第11週 |
5/02 |
Synthetic biology-Fundamentals and concepts 吳亘承 |
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第12週 |
5/09 |
Synthetic biology-Pathway and metabolic engineering 吳亘承 |
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第13週 |
5/16 |
Synthetic biology and applications 吳亘承 |
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第14週 |
5/23 |
Proteomics and expression tools 黃慶璨 |
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第15週 |
5/30 |
端午節 |
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第16週 |
6/06 |
Metaproteomics of microbiome 黃慶璨 |
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第17週 |
6/13 |
Microbial Metabolomics and its applications 黃慶璨 |
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第18週 |
6/20 |
期末考 |
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